O Centro Franciscano mantém parceria com os seguintes órgãos:
- Secretaria do Trabalho, Assistência Social e Cidadania | STASC do Município de Alvorada/RS
- Rede de Proteção Social – Centro de Referência da Assistência Social – CRAS PIRATINI Alvorada/RS
- COMPETI – (Comissão do Programa de Erradicação do Trabalho Infantil) do Município de Alvorada/RS
- COMDICA – (Conselho Municipal dos Diretos da Criança e dos Adolescentes) do Município de Alvorada/RS
- CMAS – (Conselho Municipal da Assistência Social) do Município de Alvorada/RS